Chargé de Recherche – CDD CIFRE 36 mois (H/F)

Rôle

Au sein de l’équipe responsable du développement génétique légumes, vous participez aux travaux de recherche portant sur le développement de nouvelles résistances aux virus à partir des gènes codant des phosphoglycérates kinases.

Ce poste est proposé en CDD CIFRE de 36 mois, en partenariat avec l’INRAe, et est basé en France/Saint Sauveur (31).

Des déplacements 1 à 2 fois par an, sur les zones Europe de l’Ouest sont à prévoir.

Poste à pourvoir : Q4 2023.

Le développement de résistances génétiques est un point important de l’amélioration des plantes, permettant de sauvegarder leur santé tout en limitant l’utilisation de pesticides. Une voie consiste à développer des résistances « par perte de sensibilité ». Cette stratégie permet, à partir de la modification de facteurs de la plante hôte que le virus détourne, de rendre la plante résistante au pathogène.

L’équipe du GAFL dans laquelle la thèse se déroulera s’intéresse au développement de résistances par perte de sensibilité en ayant recours à la variabilité naturelle des plantes et aux outils récents d’édition du génome 1,2.

Il est établi que de nombreux virus de plantes à intérêt agronomique détournent les enzymes métaboliques Phosphoglycérates Kinases (PGK) pour accomplir leur cycle, et notamment une Phosphoglycérate Kinase chloroplastique (cPGK) 3. Dans ce cadre de la thèse, vous étudierez comment mettre en place des résistances génétiques efficaces à partir des gènes codant pour les phosphoglycérates kinases en prenant en compte la redondance génique de ces facteurs mais aussi l’étude du compromis à obtenir entre résistance et développement de la plante. Afin de vérifier la généricité des résistances mises en place, vous travaillerez de front sur deux modèles : Arabidopsis thaliana et la tomate.

Votre travail vous permettra de développer des compétences en phytopathologie des plantes (virologie), en génétique et en biologie moléculaire. Vous chercherez à comprendre le mécanisme par lequel le virus détourne les phosphoglycérates kinases, mais aussi le rôle du compartiment chloroplastique dans la sensibilité au virus. Vous rechercherez les combinaisons d’allèles conduisant à la résistance. Pour cela, vous étudierez le mécanisme sous-jacent chez une accession naturellement résistante, mais vous développerez également des approches de complémentation et d’édition du génome basées sur la technologie CRISPR. Enfin, vous étudierez l’impact des mutations produites au sein des gènes codant des phosphoglycérates kinases sur la résistance à plusieurs virus, sur la durabilité de ces résistances et sur le développement de la plante. L’ensemble de ces travaux doit permettre de proposer de nouvelles solutions de résistances aux virus pour l’amélioration des plantes.

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Profil

Diplômé d’un BAC+5/Master en virologie, en phytopathologie ou en biologie des plantes, vous êtes à la recherche d’un contrat CIFRE dans le cadre de votre doctorat.

Vous avez de bonnes connaissances en traitement et analyses de données de grandes dimensions, des langages et outils scientifiques.

Solide expérience en sélection végétale, en génétique quantitative, en phénotypage, en outils d'analyse statistique, en biologie moléculaire et ses applications respectives.

Capacité à travailler dans une équipe interfonctionnelle, multiculturelle et internationale.

Excellente organisation, communication et capacité à innover.

Expérience en gestion de projets (y compris la gestion des ressources et des délais).

Anglais professionnel requis pour travailler dans une organisation multiculturelle (réunions, e-mails, documents).

Site non accessible par transport - des déplacements sur le terrain sont à prévoir.

Condition d’éligibilité au dispositif CIFRE :

-le candidat ne peut pas être inscrit en thèse depuis plus de 9 mois à la date de réception par l’ANRT du dossier de demande de CIFRE.

-le candidat ne doit jamais avoir souscrit de dossier doctoral précédemment

Syngenta s'engage pour la Diversité. Nous encourageons toutes les candidatures indépendamment de l'origine sociale et culturelle, de l'âge, du genre, du handicap, de l'orientation sexuelle ou des croyances religieuses.

#LI-AVA

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